Байкальский музей стал самостоятельным подразделением Сибирского отделения Российской академии наук в 1993 году. Основные направления работы — научная деятельность, экспозиционная и просветительская.

Реконструкция музея началась в 2001 году. В 2004 году создан аквариумный комплекс — 11 больших аквариумов, соединённых системой проточной воды с озером Байкал. В 2006 году открыта экспозиция «Виртуальное погружение на дно Байкала». В 2008 году — природная экспозиция «Дендропарк» и Экологический образовательный центр.

Байкальский музей в Листвянке

В 2008–2010 годах музей участвовал в подводных исследованиях Байкала с помощью глубоководных обитаемых аппаратов «Мир-1» и «Мир-2». Получено более 400 часов уникальных подводных съёмок в формате Full HD, из них 60 часов в режиме 3D-стерео. Общий объём видеоинформации — 6 терабайт.

В 2010 году открыта установка из 40 аквариумов, соединённых с озером. Она предназначена для изучения жизненных циклов байкальских эндемиков в условиях, приближенных к естественным. В том же году заработали экспозиции: «Байкал в режиме реального времени», «Живой мир Байкала под микроскопом», «История подводных исследований на Байкале». Также открыт дендропарк для изучения редких и исчезающих растений Прибайкалья.

Байкальский музей в Листвянке

В 2011 году к ним добавилась экспозиция «Развитие жизни в процессе абиотических изменений на Земле». В этом же году при музее открылась аспирантура по биологическим наукам.

В 2012 году в музей из Калининграда доставили глубоководный обитаемый аппарат «Пайсис-11». Он исследовал глубины Байкала в конце 1970-х — начале 1990-х годов. Для него открыта мемориальная экспозиция.

Байкальский музей в Листвянке

Фото: Байкальский музей Иркутского научного центра СО РАН

Автор: Ольга Бурдуковская